组织协调机关工作，负责文秘、档案、调查研究、政策法规和行政事务管理工作；同时负责项目申报，管理各项资金，做好财务管理工作，负责统计、渔业经济和渔业成本调查，管理和引进外资工作。

    (二)人事教育科

    负责局机关和直属事业单位的组织人事、党务、劳资及有关的报表、统计、职工教育、干部理论学习等工作。负责离退休人员的管理服务工作。  

    (三)科技生产科

    制订水产科技发展的中长期规划、技术进步措施；组织科技攻关；负责科技成果鉴定、验收、管理和水产科技成果推广应用与科学技术普及；负责水产种质资源库管理及引种、对外交换的审批管理；负责鱼病防治和水产技术推广网络体系建设与水生动植物检疫；指导全市水产产业和产品结构调整，负责全市水产品名特优苗种基地规划建设。

    (四)加工市场科

    指导全市水产品冷藏与加工、渔用饲料加工；收集发布水产品市场信息，指导水产品流通；拟订水产品市场体系建设规划，并组织实施；负责全市渔业对外经济技术合作与交流和外资、外援项目的引进与管理。

    (五)渔船渔港监督科

    参与制订、修改地方性渔业法规，并监督实施；管理全市水产资源，调解、查处重大渔业纠纷，维护渔业生产秩序，保障渔业生产经营者的合法权益，制订全市水产资源保护规划，保护渔业生态环境，指导全市渔业环境监测工作；负责制订全市水生野生动物保护、繁殖、开发利用的规章制度并监督实施；负责渔业行政复议作；依法检验各类渔船及船用产品，审查渔船设计建造资格；负责全市渔船渔港的监督管理，维护渔业生产和安全秩序。

    纪检、监察机构按有关规定设置。